De Molenwiek is een stichting zonder winstoogmerk, die geleid wordt door een schoolbestuur. Het bestuur bestaat uit vier ouders en is formeel verantwoordelijk voor de dagelijkse gang van zaken van de school. Het bestuur maakt het beleid en ziet erop toe dat het beleid wordt uitgevoerd. Daarnaast legt het bestuur verantwoording af aan de ouders.

Het onderwijzend team bestaat uit: Marian Andeweg, Jitske Bresser, Cindy Jorissen en Martje Swinkels (bevoegde docenten); Jacqueline Waning (onderwijsassistent plus); Pauline van Beusekom, Marijke Boeren, Kiki Edelman, Mirande Kaasschieter, Gerda van der Linden en Sanne Waning (onderwijsassistenten).